在同样大小功率的压缩机请款下，水冷式冷水机要比风冷式冷水机的制冷功率要大些，从这个角度讲，肯定是水冷冷水机好。
但从实际使用方面来说，就要看用户的使用情况了。水冷机要接冷却塔，安装位置固定后就不方便移动了。风冷式冷水机自带散热装置，不需要外接冷却水，方便移动。因此，如果使用过程中要经常移动的情况，选择风冷式冷水机组要好。
另外一种情况，如在西部或者北方容易起沙尘的地方，使用普通冷却水塔冷却水容易受沙尘污染，需要使用闭式水塔+水冷冷水机一起使用，而这两者的总价要比风冷式冷水机的成本高。因此，使用风冷式冷水机成本上比较划算。还有北方天气比较寒冷气温低于0度以下水塔会结冰影响制冷机组的正常运行，向一些地方缺水比如非洲地区就不适合水冷冷水机的使用，像以上情况建议使用风冷式冷水机组。
还有其它很多种情况，在这里就不一一举例了。总之，选择水冷冷水机，还是风冷式冷水机组，最终还是要结合自身的实际情况来合计。